積極爭取國際支持 讓世界聽到臺灣的聲音
防疫沒有國界，全球衛生安全是國際共同責任，自1997年起，為維護臺灣2300 萬人民的健康權益及善盡國際責任，政府開始積極推動臺灣重返WHO。從外交部、衛生署等政府機關到民間醫事團體齊力動員，向國際社會爭取臺灣參與WHO。吳運東適逢1998 年接任臺灣醫師會理事長，一上任就義不容辭帶頭衝刺，極力響應，希望全世界都聽到臺灣的訴求。
吳運東擔任臺灣醫師會理事長期間，積極參與各項國際會議，並前往各國拜訪國會議員、醫界團體、衛生及外交政府機關等，足跡遍布亞洲、歐洲及美洲等三十餘國，更邀集國際媒體舉行記者會向世界發聲，竭力推展醫療外交並遊說各國支持臺灣加入WHO。
推動世界醫師會支持臺灣參與WHO
世界醫師會(World Medical Association, WMA)為國際頂尖的專業醫師團體，亦為與WHO有正式緊密關係之非官方組織，其會員逾一千萬人，遍及全球114 國。吳運東擔任臺灣醫師會理事長期間，積極推動臺灣醫師會與世界醫師會交流合作，並主動邀集世界醫師會歷任之會長、各國醫師會會長等來台參訪，強化臺灣醫師會與世界醫師會及各國醫師會間之聯繫，為臺灣累積廣闊國際人脈，亦為推動臺灣參與WHO鋪路。
