吳運東1970年參與WHO在日本舉辦的肺結核防治計畫訓練時，便深深感受到參與WHO以取得相關資源並建立WHO和臺灣國內醫衛合作的重要性。當時臺灣還沒有退出聯合國，也還是WHO成員，因此WHO會定期派員指導這項肺結核防治計畫。不僅如此，當時吳運東和其他醫療、公衛專家也可以參與WHO各項會議及活動，獲得最新資訊及技術。在那段時間，臺灣醫衛專家也被聘為WHO世界各地區顧問，為全球衛生事務貢獻心力。
WHO 每年5 月在瑞士日內瓦舉行世界衛生大會(WHA)，討論全球重要公共衛生議題，訂定全球重要衛生政策與指引。1972年臺灣退出聯合國後，也被迫退出WHO，再也無法以會員國身分參與WHO 相關會議及活動，成了「世衛孤兒」，被排除於所有WHO相關全球醫衛計畫及機制之外。
